生物膜的培养通常称为挂膜。挂膜的菌种可采用生活污水的活性污泥混合液，或是采用纯培养的特异菌种菌液，或者两者混合使用。

挂膜方法一般有两种：一种是闭路循环法，即将菌液和营养液从生物膜反应器顶部喷淋而下，流出液则收集在一个水槽内，不断曝气，使菌与污泥处于悬浮状态，曝气一段时间后，进入分离池进行沉淀（约0.5～1.0H），去掉上清液，适当添加营养液或菌液，再回流打入生物膜反应器，如此形成一个闭路循环，这种方法挂膜，一般需要20H以上；另一种是连续法，即在菌液和污泥循环1～2次后即连续进水，并逐步加大进水量，但要控制好挂膜液的流速，以保证微生物的吸附；如在塔式滤池中，挂膜时水力负荷可采用废水4～7m³/（m³滤料·d），约为正常运行的50％～70％，待挂膜后再逐步提高至满负荷。为了能缩短挂膜时间，应保证营养液和污泥量以及要有适宜细菌生长的pH值、温度等条件。

挂膜后再对生物膜进行驯化，以适应所处理废水的环境。挂膜驯化后可投入试运行，找到最佳工作运行条件，并在最佳条件下转入正常运行。