废水的生物处理是利用微生物的新陈代谢作用，氧化降解废水中有机物，对废水中的污染物质进行转化与稳定，使其无机化、无害化的处理过程。这一过程的主体是微生物。常见微生物有植物型和动物型两类。植物型有藻类（主要有蓝藻、绿藻和硅藻）和菌类（主要有细菌和真菌）；动物型有原生动物和后生动物。
由于微生物的来源广，易培养，繁殖快，易发生变异，对环境的适应性强等，在应用上容易采集种菌进行培养，并在特定条件下进行驯化，使之适应废水的水质条件。微生物生存条件相对温和，新陈代谢过程不需要高温高压，不需要催化剂和催化反应，处理费用低，运行管理较为方便。所以生物处理法是废水处理应用最重要、最广泛的方法之一。
