新系统开车前或老系统检修后，一般按水冲洗、化学清洗的步骤进行清洗，然后进行预膜处理，再转入正常的化学处理运行。

（1）系统水冲洗 这是最常用的物理清洗方法。即通过较大的水流速度冲掉系统中较疏松的沉积物和碎片。水冲洗无法清除大块的建筑材料、焊渣、硬垢、腐蚀产物及大量泥沙等物。故在水冲洗之前应先进行人工清扫，先清除管道、冷却塔、水池及换热器中的杂物。水冲洗时向循环水池中充入清洁的工业用水，开循环水泵进行循环冲洗，并不断少量排污及补充水。冷却塔应设有回水旁路管，这样回水可以不经塔进行循环，可避免污染或损坏塔填料。如果水清洗时，浑浊度很高，水很脏，则各换热器也应接旁路管，水走旁路而避免污染换热器，待水清后再进换热器。循环水泵入口应设过滤网。水流速度应高于1.5m/s。为保证高水流速度，必要时可同时开启备用循环水泵。水冲洗过程中应对水中的浑浊度不断进行监测。初循环时，水中的浑浊度会增加数倍或数十倍，经过不断排、补水，浑浊度逐步降低并稳定，当补充水与循环水的浑浊度基本相等、循环水的浑浊度连续维持3H以上不再增长时，停止补充水及排水，水冲洗即完成。水冲洗一般需要24～48H。

（2）系统化学清洗 系统化学清洗的目的是清除水冲洗难以去除的油污、微生物及少量水垢和浮锈等沉积物，使金属露出活性表面。加入的药剂主要是表面活性剂或阻垢分散剂。同时加入杀生剂，并加酸适当调低pH值，有时还需加入消泡剂。

当水冲洗合格后，随即向系统投入硫酸，调节pH值，一般控制在5.5～6.5，有的控制为6.0～7.0。同时连续加氯，控制一定游离余氯量（如>0.3mg/L），直到化学清洗结束。加入清洗剂之后，每2H需对水中的浑浊度、铁离子或钙离子含量监测一次，当其增长缓慢并趋于稳定时，可停止清洗。一般待浑浊度维持3H不再增加，同时循环泵出水和回水的铁离子含量不变时，结束清洗。清洗时间大约24～48H。清洗阶段不排水、不补水。清洗结束时立即大量排水并补水，进行系统水的置换。当浑浊度降至10NTU以下时，可开始下一步的预膜工作。

（3）常用的系统清洗药剂及配方 应根据系统中垢物的组成选择化学药剂及配方。

新系统清洗的主要目的是除油污。宜采用表面活性剂清洗。常用的表面活性剂有：琥珀酸二烷酯磺酸钠（即渗透剂T）、十二烷基磺酸钠、聚氧乙烯山梨糖醇酐油酸酯（即吐温－80）等。较有代表性的国内外清洗剂组成如下：

其使用质量浓度为40～100mg/L，控制pH值为5.5～6.5。国内类似的清洗剂商品为TS－101。琥珀酸二烷酯磺酸钠又称丁二酸二酯磺酸钠，其结构式如下：

一般R为C₈H₁₇，称为琥珀酸二异辛酯磺酸钠；有的R为C₂H₅。国内商品名称为渗透剂T。

以上清洗剂除油污的效果很好，但不能除掉水垢和腐蚀产物。故国内对新旧系统清洗有的采用表面活性剂与阻垢分散剂复合使用，目的是在除去油污的同时，能够除去部分水垢和浮锈。但这种全系统的化学清洗方法也不可能彻底清除水垢，特别是难以清除腐蚀产物。系统化学清洗的配方多种多样，常用的典型复合配方如下。

a.TS－101 100mg/L，吐温－80 50mg/L，六聚偏磷酸钠50mg/L。

b.TS－101 100mg/L，六聚偏磷酸钠100mg/L。

c.吐温－80 50mg/L，羟基亚乙基二膦酸（以100％计）25mg/L，聚丙烯酸钠（以100％计）10mg/L。

d.羟基亚乙基二膦酸（以100％计）20～25mg/L，聚丙烯酸钠（以100％计）8～10mg/L。

使用表面活性剂清洗时，系统中可能产生大量泡沫，故常需投入消泡剂。循环冷却水系统中常用的消泡剂主要含液体石蜡和硬脂酸类。某种消泡剂的大致组成如下：

一般使用质量浓度为3～5mg/L，根据现场实际情况调整用量。

某些旧系统中附着有黏泥，故有的在加入清洗剂之前先加入剥离效果较好的杀生剂（如季铵盐）剥离4～8H。

低pH值有利于分散垢物，故化学清洗时均加硫酸调节pH值至微酸性。