非氧化性杀生剂的杀生机理与氧化性杀生剂不同，它不受水中还原物质的干扰，对黏泥的剥离作用好，可以弥补氧化性杀生剂的某些不足。其缺点主要是有一定毒性，对环境不利，同时费用较高。国内外有些设计在循环冷却水中不用氧化性杀生剂，只定期投加非氧化性杀生剂，例如每周或每两周加一次。这种方法费用很高，不够有效，也不够科学。所以，目前国内多不采用“定期加药”方式，而是在必要时采用冲击式的不定期加药。要做到用药有效合理，需要积累经验，根据本单位的实际情况确定。但以下原则是普遍应注意的。

（1）根据监测数据对症下药 应建立对微生物的监测手段和监测制度，对各种有害微生物的数量、黏泥量、有关化学污染物含量（如COD、NH^＋₄、NO^－₂等）进行监测，根据监测数据判断是否应投加非氧化性杀生剂。例如，有的系统平时只用氯杀生，仅在微生物失控或有其他困难时才使用非氧化性杀生剂，一般多在夏季使用3～5次。如水质较好，一年只用1～2次，甚至全年不用非氧化性杀生剂。这样既控制了微生物，又降低了费用。

（2）将微生物危害控制在苗头，适时加药 即在水质有失控倾向时及时加药，对微生物“先发制胜”，将微生物控制在大量黏泥产生之前，才能达到事半功倍的效果。因为系统中产生大量黏泥之后，就很难在不停车状态下将其清除出系统。要掌握这个原则并不容易。需要积累多年的监测数据，不断总结自己的经验和吸取其他单位的经验。掌握微生物危害的规律之后，则可将非氧化性杀生剂用得巧妙适时。例如，某厂的经验是：当NO^－₂>1mg/L、黏泥量>4mL/m³，在连续三次加氯，余氯均不合格时就投加非氧化性杀生剂。有的厂在发现有黏泥沉积倾向时采取先剥离后“围歼”的办法，先使用剥离效果好的季铵盐类杀生剂剥离黏泥，24H后进行排污处理，然后再投加SQ8之类的高效杀生剂，杀灭剥离下来浮于水中的菌藻，把微生物控制在较低数量。许多厂在系统漏油时，多采用季铵盐类杀生剂。还有的厂在停车前加药剥离系统黏泥，使水冷器及冷却塔填料上的黏泥剥落，以减少停车后清理的工作量。总之，要根据本系统的规律，掌握加药时机，千万不能拖到黏泥危害严重时才加药。