军团菌是能够传染军团病的细菌。军团病是一种急性呼吸道炎症，感染者会出现高烧、头痛、呕吐、咳嗽、浑身乏力等症状，严重时会致死。1976年美国建国200周年之际，一批退伍老兵在费城“斯特拉福美景饭店”参加会议，180人被感染，死亡多人。医学专家分离出的致病病菌被命名为军团菌。经调查证实：因军团菌在饭店的冷却水系统大量繁殖，通过空调系统进入呼吸道而使人致病。

军团菌属，已确定的有37种，其中嗜肺军团杆菌与军团菌爆发关系最密切。其为革兰阴性短小杆菌，广布于自然界，可在江、河、湖、泊，泥和砂土及冷却塔的水和黏泥中找到。适宜的生长温度是20～45℃，最佳繁殖温度是37℃，高于60℃难生存。军团菌在流动缓慢的死水区繁殖，在有藻类和原生动物（如纤毛虫类、变形虫类———阿米巴）的地方更容易繁殖。

水生军团菌是通过雾或细小水滴，即气溶胶传入空气，然后传入人的呼吸道的。虽然至今有关军团病的报道主要涉及空调冷却水系统，但工业冷却水系统所带出的水滴也完全可能传播军团菌。为此，国内外的科学家都十分重视并提醒水处理工作者认真关注工业冷却水系统的军团菌防治问题。

目前国外对军团菌的检测方法是镜检法，有的不定期测，有的每月或每季度测一次。当冷却水中菌数达到10～99个/mL时，应引起一定程度的重视；100～999个/mL时，应引起足够的重视；≥1000个/mL时，应高度重视，这很可能引起军团病的爆发。

控制军团菌的方法与控制其他微生物的方法相同，一般推荐以氧化性杀生剂为主，结合使用非氧化性杀生剂。但建议在军团菌数>100个/mL时采用连续加氯法。同时保持系统清洁，控制黏泥量，防止系统的死角聚集污垢尤为重要。必要时需对系统剥离清洗。

为预防军团菌危害，在设计、维修、管理等方面都应采取必要的措施。设计时冷却塔的总图布置应处于户外公共场所的下风向；空气入口远离有机物等污染物；采用有效的收水器，减少运行时的雾滴损失，并定期检修或更换收水器。在操作人员进行系统清洁、维护或排污等操作时，应配备劳动保护用具，如戴过滤的净化空气面罩、橡胶手套、护目镜等，防止气雾伤害。