硅酸化合物也是天然水中的一种主要杂质，研究其形态，对于制备除盐水是至关重要的。硅酸化合物存在的形态，与水的性质有关，特别是水的pH值对其影响很大。由于pH值变化，其形态也很多，也比较复杂。硅酸可以写成通式xSiO₂·yH₂O。在水中存在形态为：

当x＝1，y＝1时，成为偏硅酸H₂SiO₃；

当x＝1，y＝2时，成为正硅酸H₄SiO₄；

当x>1时，成为多硅酸，如H₂Si₂O₅等。

这些硅酸在水中的溶解度极小。从其溶度积可知（25℃时，H₂SiO₃溶度积为1×10^－11），当pH值等于6时，其溶解度只有0.005mmol/L，当pH等于7时，为0.05mmol/L。由此可知：硅酸在酸性或微酸性的水溶液中，很少以离子态存在，pH值越低，离子态的硅酸化合物越少，而胶体硅却越多。只有pH值大于10.5时，才有少量的SiO^2－₃存在。总之，在天然水中，硅酸呈溶解状态和胶体硅两种形式，不同形式硅酸的比例与水的氢离子浓度即pH值有关。

离子交换除盐处理，只能除去水中溶解状的硅酸化合物，胶体硅大都是通过混凝澄清处理予以去除。而用钼蓝法测定水中硅酸化合物时，也只能测定溶解状硅酸化合物。而全硅量的测定，要事先将胶体硅用氢氟酸转化成溶解状硅酸化合物，然后，再用钼蓝法测定。