《利用光波导模式光谱生物传感器研究二级结构对固-液界面DNA杂交动力学的影响》PDF+DOC
作者:钟连声,齐华文,潘忠诚,马汝海,何群,姜雪,赵雨杰
单位:中国医药生物技术协会
出版:《中国医药生物技术》2011年第05期
页数:6页 (PDF与DOC格式可能不同)
PDF编号:PDFZYSW2011050090
DOC编号:DOCZYSW2011050099
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目的探讨探针和靶分子二级结构对基因芯片杂交过程的影响,并完善基因芯片设计方法,提高基因芯片的重复性和特异性。方法应用二级结构分析软件Mfold设计3对25-mer完全互补的具有不同二级结构的探针和靶分子(P0T0、P3T3、P4T4)及1对尾端有2个碱基错配的探针和靶分子(P4T3)。制备醛基化传感器芯片,将终浓度为1、2、5、10、20μmol/L的探针分别固定在芯片上,与浓度为5μmol/L的N,N′-对羧苄基吲哚三菁(Cy5)标记靶分子杂交,荧光图像扫描仪检测确定最佳杂交探针浓度;以最佳探针浓度构建芯片,分别与终浓度为0.1、0.2、0.5、1.0、2.0、5.0μmol/L的Cy5标记靶分子杂交,荧光图像扫描仪检测确定最佳杂交靶分子浓度;同时用光波导模式光谱生物传感器(OWLS)实时监测其杂交过程。以0.4%SDS和0.1%NaOH分别处理杂交后芯片10、20、30、60min,荧光图像扫描仪检测芯片再生稳定性。控制靶分子进样速度和杂交时间分别为15μl/h、7h和180μl/h、0.5h,OWLS测定杂交复合物质量、杂交效率和反应速率。结果荧光图.....。
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